Målet för myndigheten är att vara ett kraftfullt stöd, av hög kvalitet och relevans, till Sveriges universitet och högskolor. Åtgärder på samtliga områden skall förankras i verksamheterna, vilket förutsätter goda kontakter och ett nära samarbete med medverkande universitet och högskolor.
NSHU - Myndigheten för nätverk och samarbete inom högre utbildning ska verka inom fyra huvudområden:
•
Stödja arbetet med breddad rekrytering
•
Pedagogisk utveckling av all högskoleutbildning
•
Fortsatt stöd till IT-stödd distansutbildning i samarbetet Sveriges nätuniversitet
•
Ny utbildning- och examensstruktur
Rådets testamente
I propositionen "Ny värld - ny högskola", 2004/05:162 lades förslag på Myndigheten för nätverk och samarbete inom högre utbildning med både nya och gamla arbetsuppgifter. Det blir ingen förändring för samarbetet Sveriges nätuniversitet (Nätuniversitetet). En del av arbetsuppgifterna kommer från Rådet för högre utbildning vid Högskoleverket. Rådet avvecklades per 1 januari 2006.